Летом 2014, в ходе боевых действий, здание понесло значительный урон. Сильно пострадал зал «Растительный и животный мир Донбасса», диорама «Святогорск».
Вопреки заявлениям «властей» на территории оккупированного Донецка, «ДНР» так и не начало обещанного восстановления экспозиции. Сегодня музей прибывает в плачевном состоянии.
